由于我國人口保持增長、飲食水平的持續提高，而優良耕地減少、水資源相對短缺，利用傳統糧糖油原料發展生物燃料的潛力在我國非常有限。利用非糧原料將是我國發展生物燃料的根本方向。

  我國早在上世紀90年代即開展以甜高粱、小桐子為原料的生物燃料生產技術研究，“十一五”以來，大批企業，包括大型企業，積極投身非糧生物燃料產業研發。目前，我國利用薯類、甜高粱、小桐子等非糧作物/植物生產燃料乙醇和生物柴油的技術已進入示范階段。木薯和甘薯乙醇技術也可實現商業化應用，廣西于2007年建成年產20萬噸木薯乙醇項目。甜高粱乙醇技術開發取得實質性進展，已開發出高品質雜交種籽，自主開發的發酵工藝和技術達到實用水平，并在黑龍江省建成年產5000噸乙醇的示范裝置。木質纖維素乙醇在原料預處理、纖維素轉化以及酶制劑生產成本等方面均取得實質性進展，在黑龍江、河南等地建成了年產數百噸和數千噸乙醇的示范生產裝置。生物柴油產業化示范工作的時機也已基本成熟，但受廢油資源收集利用量、油料植物種植基地建設進度的限制，目前只有少數生物柴油企業實現規模化持續生產，也沒有正式進入車用成品油的主要流通使用體系。其他第二代生物燃料（如合成燃料技術）目前仍處于實驗室研究和小規模中試階段。


  目前我國還沒有全面深入開展生物質能資源潛力評價。初步估算，利用廢糖蜜、食品加工業和飲食業廢油、棉籽油等廢棄糖油類資源，估計可滿足年產80萬噸燃料乙醇和200萬噸以上生物柴油的原料需求。可能源化利用的農作物秸稈和林業剩余物年產量目前約2.5億噸，且可望繼續增加，在中長期可滿足年產3000～5000萬噸第二代生物燃料的原料需求。另外，還可通過推廣良種良法、品種替換、開發劣質邊際土地等途徑發展能源植物,例如甜高粱、木薯、麻瘋樹等。相關土地評估顯示，我國現有約3200萬～7600萬公頃邊際性土地，但適合能源植物生長的土地資源有待查清。